术前术后血清cfDNA中KRAS突变是胰腺癌预后的生物标志物(回顾性研究)
1背景胰腺导管腺癌(PDAC)是一种恶性程度较高的肿瘤,其预后相对较差,5年生存率10%。KRAS基因编码RAS家族的GTP酶,而绝大多数的胰腺癌都有KRAS基因的突变,在石蜡包埋和冰冻储存的胰腺癌肿瘤组织标本中的检出率分别在67.4%和79.3%,而在血浆/血清中的检出率是40.8%。已有的研究证实,KRAS在组织中的突变与胰腺癌的不良预后有关。而液态活检有助于肿瘤的早期诊断和化疗/手术治疗反应评估。本文将KRAS突变与液态活检相结合,将术前和术后相组合,是很好的切入点。
液态活检除了血液来源之外,还有尿液、唾液、胸腔积液等可能含有肿瘤来源的遗传信息的体液检查。较为常见的检测对象有循环肿瘤细胞(CTC)、循环无细胞肿瘤DNA(cfDNA)和外泌体。本文主要涉及的是cfDNA。核酸可以通过细胞的凋亡或坏死进入血液循环,而肿瘤快速的发展进程、坏死和凋亡将导致cfDNA的水平增加。
本文通过分析PDAC术前术后的cfDNA中KRAS突变水平,来预测患者对手术的反应以及预后情况。思路清晰,检测对象是血清,相对容易获得,是临床研究中较为理想的方法。2研究方案简介
2.1研究目的
通过分析胰腺癌术前和术后的血清cfDNA中KRAS突变水平这个生物标志物来预测手术治疗效果和预后情况。
2.2研究人群及入排标准
本研究纳入年1月至年4月共45名患者,所有的患者都明确病理诊断为导管腺癌。
排除标准包括:
(1)R2手术患者;
(2)术前或者术后没有收集到血清的患者;
2.3标本类型
(1)术前血清/血浆、术后血清/血浆—提取cfDNA
(2)石蜡包埋的组织—提取肿瘤组织的DNA
(3)胰腺癌细胞系
2.4实验技术
(1)石蜡包埋组织的DNA提取
(2)血清/血浆cfDNA的提取
(3)肽核酸(PNA)-引导下的PCR发夹技术(PNA分析法)
2.5观察指标
临床信息:年龄、性别、糖尿病史、肿瘤家族史、新辅助化疗史、手术方式、手术时间、失血量、并发症、切缘情况,肿瘤大小,胆道是否浸润,TNM分期、分级、是否新辅助化疗、淋巴结转移、辅助治疗、术前化疗、辅助治疗、首次复发部位、住院时间、无疾病生存时间、总生存时间等
实验结果:cfDNA中KRAS突变水平
2.6研究步骤
(1)利用细胞中的DNA突变情况验证PNA分析法的可靠性;
(2)利用PNA分析法分析胰腺癌患者术前和术后血清/血浆中cfDNA的KRAS突变情况,将其分为四组(术前突变pre+/术后突变post+、术前不突变pre-/术后突变post+、术前突变pre+/术后不突变post-、术前不突变pre-/术后不突变post-),构建血清/血浆中KRAS突变与预后的关系。
2.7统计分析方法
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